COPAS NACIONALES

Paralelamente a los campeonatos de cada división, se disputan una serie de Copas oficiales, desarrolladas por diferentes entidades, reconocidas por AFA. En la actualidad se disputan la Copa Argentina y la Supercopa. San Lorenzo ha logrado obtener 2 títulos a lo largo de su historia.

 Copa Argentina

COMPETICIÓN	POSICIÓN
Copa Argentina 1969	Cuartos de Final
Copa Argentina 1970	Finalista*
Copa Argentina 2011/12	Cuartos de Final
Copa Argentina 2012/13	Subcampeón
Copa Argentina 2013/14	Octavos de Final
Copa Argentina 2014/15	Cuartos de Final
Copa Argentina 2015/16	Cuartos de Final
Copa Argentina 2016/17	Dieciseisavos de Final

*No se disputo la final de vuelta y el torneo quedo inconcluso.

 Supercopa Argentina

COMPETICIÓN	POSICIÓN
Supercopa Argentina 2015	Campeón

 Copas Extintas
Copa de Competencia de la Liga Argentina 1932 - Semifinales
Copa de Competencia de la Liga Argentina 1933 - Subcampeón 
Copa de la República 1943 - Campeón
Copa de la República 1944 - Primera Fase
Copa de Competencia Británica 1944 - Cuartos de Final
Copa de Competencia Británica 1945 - Primera Fase
Copa de Competencia Británica 1946 - Subcampeón 
Copa Centenario de la AFA 1993 - Semifinales
Copa Campeonato 2013/14 - Finalista